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Statistische Methoden in der Genetik (Bioinformatik) WS201819

Allgemeine Informationen

 

Termine der Vorlesung:

Mo, 12:30 - 14:00 Uhr in M/E 21

Mi, 12:30 - 14:00 Uhr in M/E 21

 

Erste Vorlesung: Mo, 08.10.2018, 12:30 Uhr in M/E 21

 

Termine der Übungen:

Mo, 14:15 - 15:45 Uhr in M/E 27

Di, 8-10 oder Di, 10-12, TBA

 

Folien zur Vorlesung sowie alle Materialien zur Übung findet man auf der Moodle-Seite der Veranstaltung.

 

Termine der Klausur und der Nachklausur:

Hauptklausur: TBA

Nachklausur: TBA

 

Inhaltliche Übersicht der Vorlesung

    Einführung
    Sequenzanalyse
    - Sequenzmodellierung (Markov-Ketten, Hidden Markov Modelle (HMMs))
    - Sequenzevolution (Markov-Prozesse, Scorematrizen)
    - Phylogenie
    - Sequenzalignments
    Expressionsdaten
    - Vorverarbeitung (Normalisierung)
    - Clusteranalyse
    - Diskriminanzanalyse
    - Variablenselektion (Auswahl interessanter Gene/Proteine)
    - Gengruppentests
    - Dosisreihen, Zeitreihen
    - Genetische Netzwerke
    Krankheitsprogression
    Proteomik