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Statistische Methoden in der Genetik II (Bioinformatik) WS2015/16

Allgemeine Informationen

 

Termine der Vorlesung:

Di, 14:00 - 15:30 Uhr in M/E 21

Fr, 10:15 - 11:45 Uhr in M/E 21

Termine der Übung:

Mo, 12.30-14.00 M / E27

Mo, 14.15-15.45 M / E27

 

Am Freitag, den 12.02.2016 findet die Vorlesung in Raum CDI 121 statt.

 

Folien zur Vorlesung sowie alle Materialien zur Übung findet man auf der Seite

www.statistik.tu-dortmund.de/~rahnenfuehrer/Bioinformatik1516/
Benutzer: Bioinformatik1516
Passwort: Erhält man, indem man das Wort tuvefou transformiert, jeweils einen Buchstaben durch den Vorgänger im Alphabet ersetzen (aus t wird s usw.)

 

 

Kapitel der Vorlesung

1. Einführung

Sequenzanalyse

   2. Sequenzmodellierung (Markov-Ketten, Hidden Markov Modelle (HMMs))

   3. Sequenzevolution (Markov-Prozesse, Scorematrizen)

   4. Phylogenie

   5. Sequenzalignments

Expressionsdaten

   6. Vorverarbeitung

   7. Clusteranalyse

   8. Diskriminanzanalyse

   9. Variablenselektion (Auswahl interessanter Gene)

  10. Gengruppentests

  11. Zeitreihen

  12. Genetische Netzwerke

13. Krankheitsprogression

14. Proteomik

 

Übungen

 

Zusatzmaterialien