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Statistische Methoden in der Bioinformatik SS2009

 

Allgemeine Informationen

Termine der Vorlesung:

Di, 10:15 - 11:45 Uhr in M/E 25

Do, 8:30 - 10:00 Uhr in M/E 25

 

Termin der Übungen (Teilnahmepflicht an einem der beiden Termine):

Mo, 10:30 - 12:00 Uhr in CDI 119

Mo, 14:00 - 15:30 Uhr in CDI 119

 

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Folien der Vorlesung

Nr.Datumpdfpdf(4seitig)Kapitelstart
1.)14.04.2009[pdf1]
[pdf2]
[pdf3]
[pdf4x]1. Statistische Methoden in der Bioinformatik: Einführung
2.)16.04.2009[pdf][pdf4x]

2. Markovketten – Sequenzmodellierung

3.)21.04.2009[pdf][pdf4x]3. Markov-Prozesse – Scorematrizen
4.)23.04.2009[pdf][pdf4x]4. Evolutionäre DNA-Modelle
5.)28.04.2009[pdf][pdf4x]5. Phylogenie
6.)30.04.2009[pdf][pdf4x]6. Sequenzalignments
7.)05.05.2009[pdf][pdf4x]
8.)07.05.2009

[pdf1]

[pdf2]

[pdf4x]7. Expressionsdaten: Bildanalyse
9.)12.05.2009[pdf][pdf4x]8. Expressionsdaten: Normalisierung
10.)14.05.2009[pdf][pdf4x]
11.)19.05.2009[pdf][pdf4x]9. Expressionsdaten: Affymetrix
12.)26.05.2009[pdf][pdf4x]
13.)28.05.2009[pdf][pdf4x]10. Expressionsdaten: Klassifikation
14.)09.06.2009[pdf][pdf4x]11. Expressionsdaten: Clusteranalyse
15.)16.06.2009[pdf][pdf4x]
16.)18.06.2009[pdf][pdf4x]
17.)23.06.2009[pdf][pdf4x]12. Expressionsdaten: Diskriminanzanalyse
18.)25.06.2009[pdf][pdf4x]
19.)30.06.2009[pdf][pdf4x]13. Differentielle Genexpression
20.)02.07.2009[pdf][pdf4x]14. Gengruppentests
21.)07.07.2009[pdf][pdf4x]
22.)09.07.2009[pdf][pdf4x]15. Analyse von CGH-Daten – Tumorprogression
23.)14.07.2009[pdf][pdf4x]
24.)16.07.2009[pdf][pdf4x]
25.)21.07.2009[pdf][pdf4x]16. Analyse von ArrayCGH-Daten
26.)23.07.2009ohne pdf

Übungsblätter 

1.   Übungsblatt [pdf]

2.   Übungsblatt [pdf]
3.   Übungsblatt [pdf]
4.   Übungsblatt [pdf]
5.   Übungsblatt [pdf]
6.   Übungsblatt [pdf]
7.   Übungsblatt [pdf]
8.   Übungsblatt [pdf]
9.   Übungsblatt [pdf]
10. Übungsblatt [pdf]
11. Übungsblatt [pdf]

 

Zusatzmaterialien 

 

 

Literatur

Bioinformatics needs to adopt statistical thinking [pdf]
Evaluating the performance of microarray segmentation algorithms[pdf]
Einführung in Bioconductor[pdf]
A benchmark for Affymetrix GeneChip expression measures[pdf]